合伙协议和公司章程的主要区别在于：合伙协议是股东间的约定，不是法律强制性文件，约束力相对较窄，但对合伙人间关系重要；而公司章程是公司的，是法律必备文件，约束力广泛，适用于公司的所有行为。虽然合伙协议不是必需的，但建议公司签署股东协议，因为其内容与公司章程有所不同。
法律分析
合伙协议和公司章程的区别有：
(一)在法律上，合伙协议是指股东之间就要发起设立的一个组织，包括股权架构和相关的权利架构、出资等，是很初始的权利义务的约定。从法律上，公司章程是公司的，公司、股东、高管等的所有行为规范都必须遵守这个最高的规则。公司法的公司章程是有法律强制性规定的，不一定要签署股东协议，但是必须要有公司章程。
(二)合伙协议并不是一个必备的法律文件，要约定也可以，不要约定也不影响。不过我们建议公司还是要签股东协议，因为股东协议的内容和公司章程还是不一样的。
(三)关于约束力，合伙协议属于协议，就是协商，可以讨价还价，合同具有相对性原则。合伙协议的约束力相对比较窄，有参与才有约束，所以这是股东之间的一种任意性的合同，但不能约束协议外当事人。公司章程的约束力比较广，是法律必备的文件，公司章程可以约束公司的行为。合伙协议仅仅是合伙人之间的一种约束，但如果协议写得好，对合伙人之间而言，其重要性比公司章程还要重要。
拓展延伸
合伙协议与公司章程的比较及适用场景
合伙协议和公司章程是在不同法律背景下用于规范合作关系的文件。合伙协议主要适用于合伙企业，明确合伙人之间的权利、义务和利益分配等事项。公司章程则适用于公司组织形式，规定了公司的经营管理、股东权益和决策程序等内容。在比较上，合伙协议更加灵活，适用于小型合作关系，允许合伙人自主约定；而公司章程更加正式，适用于大型企业，受法律监管。因此，在选择使用合伙协议还是公司章程时，应根据合作关系的规模、法律要求和合作方之间的需求进行综合考虑，以确保合作关系的合法性和可持续性。
结语
合伙协议和公司章程的区别在于法律地位和约束力。合伙协议是股东之间的初始约定，不是必备的法律文件，约束力相对较窄。而公司章程是公司的，具有法律强制性规定，约束力更广。尽管合伙协议不是必须的，但建议公司签署股东协议，因为其内容与公司章程有所不同。合伙协议对股东之间具有重要约束作用，若写得好，其重要性甚至超过公司章程。
法律依据
《合伙企业法》第四条规定，合伙协议依法由全体合伙人协商一致、以书面形式订立。
